Organizačná štruktúra od 1. februára 2013

A.1. Kancelária generálneho riaditeľa
A.2. Oddelenie personalistiky a miezd
A.3. Oddelenie bezpečnosti a odbornej ochrany
A.4. Oddelenie produkcie projektov a výstav
A.5. Kontrola
A.6. Vysunuté pracoviská

B. Úsek výskumu a rozvoja
B.1. CEDVU a digitálne zbierky
B.2. Archív výtvarného umenia
B.3. Knižnica
B.4. Riadenie projektov
B.5. Register
B.6. Digitálna galéria

C. Úsek hospodárskeho riadenia
C.1. Oddelenie finančného riadenia
C.2. Oddelenie správy budov
C.3. Správa IT
C.4. Investície

D. Úsek marketingu a komunikácie
D.1. Oddelenie marketingu a tvorby programov
D.2. Oddelenie galerijnej pedagogiky

E. Zbierky starého umenia
Zbierka gotického umenia
Zbierka európskeho maliarstva
Zbierka barokového umenia
Zbierka umenia 19. storočia
Zbierka starej kresby a grafiky

F. Zbierky moderného a súčasného umenia
Zbierka moderného a súčasného maliarstva
Zbierka modernej a súčasnej kresby a grafiky
Zbierka moderného a súčasného sochárstva
Zbierka fotomédií
Zbierka nových médií (Iných médií)
Zbierka úžitkového umenia
Zbierka architektúry
Zbierka insitného umenia